root не пускает в X-ы, как это отключить - не знаю.
Можно воспользоваться sudo для выплонения приложений требующих админ. прав.
В консоли (переключение - Alt+Ctrl+F(1-6)) root спокойно проходит.
А никак это не нужно отключать - если вам понадобилось запустить иксы от пользователя root это может означать только одно - вы делаете что-то неправильно.