Однако не отражен вопрос о заливке в NAND флеш UBIFS образа rootfs (файловой системы Linux).
Подскажите, пожалуйста, каким образом после заливки u-boot и zImage мы можем записать
в nand образ rootfs ?

На случай аварии корневой файловой системы, предусмотрен режим «Safe boot», для
его активации необходимо прервать загрузку в U-boot (нажав на любую клавишу) и
выполнить команду «run boot_safe». Загрузится образ системы, в котором корневая ФС
расположена в памяти и можно будет приступить к ремонту основной корневой ФС,
например, запустить скрипт «install_rootfs», в результате работы которого будет заново
отформатирован второй раздел NAND flash, скопирован с TFTP сервера и распакован
архив корневой ФС.

1. С помощью SAM-BA грузим bootstrap и u-boot в первую партицию MTD
2. С помощью u-boot грузим safe Linux (initrd - root файловая система)
3. Пользуемся штатными драйверами Linux монтируем форматируем заливаем на вторую партицию MTD все что нам угодно
4. Грузимся..., вторая партиция - root fs

Вы сами именно так заливаете NAND-ы ?

добрый день! не получается восстановить систему через SD карточку.
все проходит нормально, в конце пишет

umount: can't umount /dev/mmcblk0: Invalid argument
UBIFS: un-mount UBI device 0, volume 0
The system is going down NOW!
Sent SIGTERM to all processes
Sent SIGKILL to all processes
Requesting system reboot
Restarting system.

и ничего. с перемычкой на J1 не стартует

Неправильный вывод, почитайте внимательней по приводимой ссылке.