Зачем что-то собирать если используете дистрибутив ? Настройка и установка из пакетного менеджера ничем не отличается от PC - гуглите как это делается для обычного PC на x86.
ARM плохо подходит для сетевых приложений если вам нужен нагруженый сервер, если это какой-то простенький сервер с небольшой нагрузкой то подойдет любой у которого есть встроенный Ethernet MAC (у i.mx23 например внешний EMAC на SPI так что это не лучший вариант) и на котором работает Linux и желательно с MMU - на главной такие платы отмечены пмнгвином.
Огласите весь список того что нужно будет кроме веба :) Я могу сказать пока что точно вам не надо брать - это SK-iMX233, SK-MNUC950 , SK-LPC2478-S3E. В остальном - ориентируйтесь по цене или подождите HOLA на i.mx6 - вот это точно лучший выбор по соотношению цена/возможности. http://www.starterkit.ru/html/index.php?name=forum&op=view&id=21013&last#21013