Имеется собственная плата, точнее несколько видов плат, с процессором SAM9G45. Ранее стояла ОЗУ DDR2 MT47H32M16HR-25IT:G и с ней прекрасно работало всё на ядре версии 2.6 и на новом ядре 4.8.6. Микросхему памяти DDR2 обновили до ревизии H: MT47H32M16NF-25IT:H. По даташиту ничего не поменялось, но есть нюансы - на ядре 2.6 вроде грузится, тесты проходят, а вот на свежем ядре 4.8.6 на этапе загрузки безопасного режима (safe_boot) происходят сбои.

В какую сторону копать не понимаю, может есть у кого то идеи?

ИМХО SAM9G45 (хотя, туда же большую часть продукции Atmel можно отнести) это не процессор а полное ...
Описываемые события, вполне в духе его поведения, в частности у нас он работает исключительно на чипах от самсунг и причем только одной ревизии, в текущий момент на микроне в принципе не запускается (и это на частоте 130МГц - позор!), в добавок новые "чудеса" могут подстерегать на следующей партии процессоров этой же ревизии (в атмел есть понятие - внутренняя ревизия).
В основном, по этой причине сняли с производства все изделия на 9G45 (за исключением модулей - их снимем в мае 2022г).
Есть конечно небольшое подозрение, из-за малых партий закупаться процессорами приходится не у глобальных дистрибьютеров, а у местных "барыг" (они конечно тоже имеют дистрибьюцию атмел, но это их ни к чему не обязывает - возьмут где дешеле) и они под видом "оригинала" привозят "что то" из китая ...
Т.к. у этой поделки под названием Процессор нет настроек скорости нарастания у выходных буферов и т.п. поделать тут нечего, кроме как попробовать увеличить временные интервалы таймингов для чипа памяти - может и поможет.

с прошлой ревизией одних из наших плат была проблема с разводкой, там мы уменьшали частоту ядра, и вместе с ней и частоту памяти, тогда это у нас помогло.
сейчас на этих же настройках, и на настройках по умолчанию, новые чипы работают только на ядре 2.6, но в том ядре нет поддержки некоторого функционала...

процы все ревизии С, год выпуска около 2019-2020. на счет "китайщины" сложно сказать, вроде у крупных дилеров берем.
старая память ревизии G до 2018 г работает, новая память ревизии H 2020 г не работает.

может у атмела есть какой то список совместимых озу?