1) Вот ссылка откуда скачал:

http://wiki.starterkit.ru/%D1%87%D1%82%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5-%D0%B7%D0%B0%D0%BF%D0%B8%D1%81%D1%8C_%D1%84%D0%B8%D0%B7%D0%B8%D1%87%D0%B5%D1%81%D0%BA%D0%B8%D1%85_%D0%B0%D0%B4%D1%80%D0%B5%D1%81%D0%BE%D0%B2_%D0%B2_linux
2) откомпилирова кросс-компилятором из комплекта платы
3) запустил ./gpio.out
4) в терминале выводит сообщения, а подключенные светодиоды (через резисторы) не один не мигает.

Цитата

4) в терминале выводит сообщения, а подключенные светодиоды (через резисторы) не один не мигает.

ох ёлки.. пора ФАК писать по правилам задавания вопросов..
1. АРМ - имя?
2. схема включения?

впрочем, если сложить текущий раздел "SK-MAT91SAM9G45/M10" и фразу в вышеупомянутом факе "Как дрыгать ногой SAM9260", то вероятная причина неработоспособности в неправильном задание базовых адресов GPIO.. у этих камней они чуть отличаются..
на эти грабли я наступал, где-то на форуме написано..

Jury093 Спасибо за ответ.
1) Ты прав имя ARM = имени ветки SK-MAT91SAM9G45/M10
2) подключил к порту X1 (от порта 40-контактов шлейф далее к маектной плате. На макетной плате разъем на 20-контактов и к 10-припаяныы через резисторы светодиоды)
3) Какой базовый адрес GPIO задать?
4) можно ли исправить программу чтобы она дрыгала ногами сразу всего порта X1 ? Что править?

3. что-то типа этого
http://www.starterkit.ru/html/index.php?name=forum&op=view&id=10100#10174
поправить базовый адрес под свой блок регистров - адреса смотреть в мане на камень

Код

#define GPIO_BA 0xFFFFF600 // GPIO C

учесть замечание Бойко Алексея

4. самое удачное, если пины идут подряд e.g. A[0],A[1],A[2] etc
тогда в переменную записываешь например байт и двигаешь на нужное число разрядов, чтобы биты "попали" на правильные провода. после чего выводишь оптом весь регистр
если пины идут вразнобой, то сначала их "собираешь" в правильную последовательность, используя промежуточную переменную, а потом оптом выводишь..