Валится скорей всего потому что версии ядер для холы и imx6q - разные. У фрискейла юзерспейсные бибилотеки OpenGL для GPU привязаны к опреденному релизу ядра, например библиотеки 3.0.35-1.1.0 не будут роботать с ядром 3.0.35-4.1.0 так что надо быть внимательным в этом плане. Ничего конкретно предпринимать не надо - один и тот же юзерспейс должен работать на любом процессоре i.mx6 - Q/D/DL/S