Действительно была проблемка, мешал
#define MX6_SK_ECSPI4_CS0 IMX_GPIO_NR(3, 20)
переправил на #define MX6_SK_ECSPI4_CS0 IMX_GPIO_NR(3, 29)

Потом поставил

MX6DL_PAD_EIM_D20__GPIO_3_20
выход заработал нормально, поставил

MX6DL_PAD_EIM_D20__UART1_RTS

GPIO выход работать перестал, но RTS не заработал.

Пробую своей программкой. Для эксперимента подключил USB-RS232 переходник, проверил, на нем RTS меняется. В логах ничего похожего не нашел.
Изменения делаю в файле arch/arm/mach-mx6/board-mx6q_sabrelite.c
static iomux_v3_cfg_t mx6dl_sabrelite_pads[] = {
...

Цитата

MX6DL_PAD_EIM_D20__GPIO_3_20
выход заработал нормально, поставил

ок.
т.е. к железу претензий нет. значит дело в настройках или их отсутствии..

Цитата

MX6DL_PAD_EIM_D20__UART1_RTS
GPIO выход работать перестал, но RTS не заработал.

мне не доводилось поднимать полный уарт на IMX, но в соседнем файле (board-mx6sl_evk.c) есть такая настройка:

Код

static const struct imxuart_platform_data mx6sl_evk_uart4_data __initconst = {
.flags = IMXUART_HAVE_RTSCTS,
.dma_req_rx = MX6Q_DMA_REQ_UART4_RX,
.dma_req_tx = MX6Q_DMA_REQ_UART4_TX,
};

а в функции _probe драйвера есть проверка:

Код

if (pdata && (pdata->flags & IMXUART_HAVE_RTSCTS))
sport->have_rtscts = 1;

покопайте в этом направление..

Цитата

в общем случае, если разрешена работа в ядре:
включаем работу с пином через sysfs
echo K > /sys/class/gpio/export
если команда прошла успешно, соответствующий пин доступен для чтения командой

У меня при выполении "echo 46 > /sys/class/gpio/export" для GPIO2_14 вываливается ошибка:
write error: Device or resource busy
(сбока на базе buildroot-2014.08 на базе ядра 3.10.17 для i.mx6 для HolaDuo+IEB)
Подскажите пожалуйста, в чем проблема?

Цитата

Подскажите пожалуйста, в чем проблема?

Ну вы даете - прямо в этой теме написана причина
http://starterkit.ru/html/index.php?name=forum&op=view&id=23908&num=2#23974

на HolaDuo+IEB
linux-imx_3.10.17_1.0.2_ga-sk/arch/arm/boot/dts/imx6q-hola-ieb.dts


&pcie {
reset-gpio = <&gpio2 14 0>;
status = "okay";
};