Ну с ядром нужно было обновить и корневую файловую систему - где же ядру модули искать?
P.S. Я вообще всегда все нужное статически компоную и таких порблем не возникает.
все просто как мычание.
сходите на хост-машине в линуксе в каталог /lib/modules
там увидите подкаталог(и) типа 2.6.xx или похожее
в подкаталоге (типа 2.6.xx) будет лежать заветный modules.dep
изучите содержимое
потом на плате создаете каталог, например mkdir /lib/modules/2.6.34
и там.. создаете файл modules.dep
с нулевой длиной, если вам нечего написать внутрь
или с полным путем до вашего модуля, если он есть
например есть модуль
иногда требуется режим подгрузки/выгрузки модуля
например, в целях экономии памяти, выгружать модули поддержки накопителей при отсутствие sd/mmc или usb флешей..
опять же, если организовывать работу в режиме USB device multiservice, то запросив у пользователя нужный режим, можно подгружать соответствующий модуль -
usb mass storage
usb audio
usb modem
etc